De afdeling Bedrijfsvoering beheert het gebouw, de infrastructuur, de financiën en voert de personeelsadministratie. Daarnaast draagt de afdeling zorg voor het beleid rond bewaking en veiligheid. De afdeling Bedrijfsvoering staat o.a. in voor de uitbouw en de realisatie van enkele specifieke commerciële opdrachten van het museum. Haar ondersteunende rol is elementair voor de optimale uitvoering van de opdrachten van de andere afdelingen en moet borg staan voor een goede bezoekerservaring. Streefdoelen het museum op een moderne en professionele wijze beheren, ten opzichte van het eigen personeel, de bezoeker, de Vlaamse overheid en andere museaover een museumgebouw te beschikken dat de cultuurhistorische waarde van het gebouw combineert met de hedendaagse vereisten van een museale infrastructuureen bewakings- en veiligheidsbeleid voeren dat een veilige omgeving voor de bezoekers en werknemers creëert en een maximale beveiliging van de collectie verzekertover kennisbeheer beschikken dat het top- en lijnmanagement adviseert en ondersteunt.